Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC169A6NNP5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms