Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WIPF3A6NGB9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WIPF3A6NGB9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WIPF3A6NGB9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WIPF3A6NGB9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WIPF3A6NGB9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms