Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMP2A6NFY4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMP2A6NFY4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEMP2A6NFY4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEMP2A6NFY4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMP2A6NFY4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms