Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms