Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XIRP2A4UGR9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms