Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSAPA4D1B5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSAPA4D1B5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms