Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC66A2RUB6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms