Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBA6A0AVT1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms