Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A1W2PQD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1W2PQD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQD8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQD8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQD8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQD8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms