Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPC4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPC4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms