Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 422.9 ms