Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 OR2A5-201ENST00000408906 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC011290.1-201ENST00000439751 414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 TCP10-205ENST00000476779 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 MYADML-202ENST00000490394 797 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC015909.2-201ENST00000523083 547 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 ZNF7-209ENST00000529819 513 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 LINC02413-202ENST00000552353 898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC089998.4-201ENST00000552532 459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC090409.1-202ENST00000586949 653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC005580.1-201ENST00000592311 583 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 MIR6776-201ENST00000616678 59 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 LINC01715-201ENST00000420776 624 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 PPP3CB-AS1-201ENST00000422977 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 FAAP24-205ENST00000590281 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 ANXA3-209ENST00000512884 1335 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCDH10Q9P2E7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms