Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK8P49336 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK8P49336 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms