Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PADI6-201ENST00000619609 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GAMTP2-201ENST00000430917 463 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC011472.2-201ENST00000586356 655 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PRSS2-205ENST00000632998 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ZNF772-209ENST00000615214 1506 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PRAMENP-203ENST00000548391 1445 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC104041.1-202ENST00000560097 566 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC022150.2-201ENST00000596451 644 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC026401.3-201ENST00000624682 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 NME1-201ENST00000013034 796 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 IGLV3-22-201ENST00000390307 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 HLA-U-204ENST00000418981 186 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 POU5F1-205ENST00000512818 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC138956.2-201ENST00000512934 528 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 RPL12-205ENST00000536368 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 LINC00868-203ENST00000592919 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC244517.2-204ENST00000624802 415 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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