Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 CABYR-203ENST00000399496 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTF1AQ7RTS3 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms