Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 LINC02354-202ENST00000548564 573 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 RN7SL732P-201ENST00000581157 300 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TUSC8-201ENST00000432701 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PFN1P4-201ENST00000450970 402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms