Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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HOXD8P13378 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HOXD8P13378 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HOXD8P13378 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HOXD8P13378 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HOXD8P13378 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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