Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GLI3P10071 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GLI3P10071 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GLI3P10071 DHRS1-202ENST00000396813 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GLI3P10071 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AC003101.1-201ENST00000412403 459 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AC011890.1-201ENST00000427955 303 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 MTND6P14-201ENST00000433044 522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 CHORDC2P-201ENST00000557601 1090 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AC091588.2-201ENST00000578741 366 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AC104982.2-201ENST00000584258 893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 KIR2DP1-201ENST00000415311 1331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 RNA5SP469-201ENST00000364165 109 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AK4P5-201ENST00000404520 634 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 TMEM176A-201ENST00000004103 1261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AL031773.1-201ENST00000453579 554 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 RN7SL833P-201ENST00000498758 284 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ODF3-203ENST00000525282 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AC073655.1-201ENST00000550111 493 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AP005203.1-202ENST00000584204 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 MIR7-3HG-204ENST00000588758 865 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AL590096.1-202ENST00000618162 580 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 HNRNPA1P19-201ENST00000405292 370 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 RPL10P12-201ENST00000427342 318 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 OR7E33P-201ENST00000437705 966 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AL355309.1-201ENST00000442158 78 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 COQ5-202ENST00000445328 992 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 AC103925.1-201ENST00000453155 771 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI3P10071 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms