Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP89Q96ST8 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms