Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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