Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDPQ00604 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDPQ00604 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms