Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC136475.6-201ENST00000533113 289 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD1P28340 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms