Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms