Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MAS1LP1-206ENST00000419416 1047 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2APS4-202ENST00000635537 681 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms