Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RRN3P1Q2M238 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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