Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms