Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PPM1N-204ENST00000401593 548 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC006022.1-201ENST00000425261 388 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GPAT2P2-201ENST00000445404 863 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LINC00879-202ENST00000463200 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC046168.2-202ENST00000561123 926 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 HPR-203ENST00000561690 634 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC009086.1-201ENST00000567219 309 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 APOC1P1-202ENST00000571466 253 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC093159.2-201ENST00000603429 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 C17orf75-202ENST00000577809 1642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 NCR1-205ENST00000594765 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 CCDC70-201ENST00000242819 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 IGLV1-44-201ENST00000390297 467 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 CYTH4-202ENST00000402997 633 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AL355298.1-201ENST00000425391 180 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TCP10-205ENST00000476779 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 EXOSC1-210ENST00000485122 564 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TMEM255B-205ENST00000488362 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC008040.3-201ENST00000493762 1232 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SNHG14-220ENST00000553149 513 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC008761.2-201ENST00000600512 419 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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PTPRMP28827 AC003101.1-201ENST00000412403 459 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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PTPRMP28827 RN7SL307P-201ENST00000490342 295 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ZNF7-209ENST00000529819 513 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 B2M-202ENST00000544417 933 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 MYL6B-207ENST00000550443 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 MYL6B-210ENST00000552568 703 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 NTM-201ENST00000374784 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 QRFPR-201ENST00000334383 1215 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 KRTAP19-1-201ENST00000390689 646 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC005838.1-201ENST00000430712 233 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AL139220.1-201ENST00000436802 520 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 LILRB1-AS1-201ENST00000456337 554 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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