Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CNIH4Q9P003 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms