Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTF1AQ7RTS3 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms