Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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