Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 GPM6B-203ENST00000356942 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC008040.3-201ENST00000493762 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AL589843.2-202ENST00000602289 740 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LINC02354-202ENST00000548564 573 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 MIR7-3HG-204ENST00000588758 865 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AL157414.1-201ENST00000366097 770 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AL592463.1-201ENST00000451108 635 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CTSLP1-201ENST00000457530 1002 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LINC00877-202ENST00000464271 552 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AL118557.1-201ENST00000554408 440 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC245297.1-201ENST00000313342 933 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LINC01849-201ENST00000414647 517 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ZFR2-203ENST00000439086 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 DDTP1-201ENST00000443589 383 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 COQ5-202ENST00000445328 992 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CHIA-207ENST00000451398 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AP003469.2-201ENST00000524369 430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC006581.2-201ENST00000631830 455 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms