Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 OR13C2-201ENST00000542196 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 IFI27-212ENST00000618863 505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 AC026401.3-201ENST00000624682 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 CEP70-208ENST00000474781 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 INO80C-203ENST00000441607 904 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 LIN28B-AS1-204ENST00000636951 610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 GPR12-201ENST00000381436 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 USP4-204ENST00000416417 1536 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 IGHVII-65-1-201ENST00000519992 302 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 AL139035.1-202ENST00000626308 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NESP48681 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 AL355802.1-201ENST00000417591 990 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 SGCZ-202ENST00000421524 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 CHN2-209ENST00000421775 825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 MRO-205ENST00000436348 1125 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 AF274858.2-201ENST00000446370 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 AC099681.2-201ENST00000449899 543 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 TRAIP-202ENST00000469027 1145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 MXRA7-206ENST00000589082 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 BTNL2-201ENST00000374993 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NESP48681 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 LINC01551-201ENST00000399387 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 PRAMENP-203ENST00000548391 1445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 IGLV3-22-201ENST00000390307 409 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 RN7SL614P-201ENST00000461850 280 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 RN7SL265P-201ENST00000486808 300 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 OR7E26P-201ENST00000502808 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 TPD52L1-206ENST00000524679 915 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 MIR4761-201ENST00000585066 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 MIR4527HG-201ENST00000586905 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 TCF4-AS1-201ENST00000587660 396 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 SIGLEC21P-201ENST00000598990 1010 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 AC093159.2-201ENST00000603429 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 Metazoa_SRP.76-201ENST00000619429 290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 LYNX1-205ENST00000620006 868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NESP48681 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NESP48681 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 KCNK16-202ENST00000373229 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms