Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMPOP42166 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms