Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFNP31947 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFNP31947 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms