Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms