Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PPIG-208ENST00000462903 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 WFDC2-201ENST00000217425 356 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 CCDC103-203ENST00000410027 571 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC073472.1-201ENST00000441433 803 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC023983.1-201ENST00000579347 567 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRXP46100 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MDP1-201ENST00000288087 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 U3.49-201ENST00000391065 214 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AF274858.2-201ENST00000446370 617 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 USP2-AS1-203ENST00000530002 764 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC087190.3-201ENST00000562893 753 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SIGLEC17P-201ENST00000593736 484 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRXP46100 IP6K2-219ENST00000446860 1565 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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