Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms