Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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