Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms