Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms