Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms