Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms