Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms