Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms