Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGNL1Q0VF96 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms