Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPL23P62829 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPL23P62829 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPL23P62829 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 CELF2-AS1-201ENST00000379256 2468 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPL23P62829 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 CHST4-202ENST00000539698 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPL23P62829 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms