Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PTCHD1-201ENST00000379361 13714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MYO7B-203ENST00000428314 6715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms