Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms