Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ACTBP60709 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ACTBP60709 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ACTBP60709 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ACTBP60709 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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