Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms